Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
BRSK1Q8TDC3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRSK1Q8TDC3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms