Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SPTSSBQ8NFR3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms