Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD53Q8N9V6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD53Q8N9V6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms