Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZIC4Q8N9L1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZIC4Q8N9L1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms