Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMCO5AQ8N6Q1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMCO5AQ8N6Q1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms