Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00518Q8N0U6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms