Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC9A9Q8IVB4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A9Q8IVB4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms