Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT28Q7Z3Y7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms