Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.57■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.55■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.55■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
BRINP3Q76B58 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRINP3Q76B58 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms