Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMUB2Q71RG4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms