Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP50Q70EL3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP50Q70EL3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP50Q70EL3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP50Q70EL3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP50Q70EL3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP50Q70EL3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP50Q70EL3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP50Q70EL3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP50Q70EL3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USP50Q70EL3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USP50Q70EL3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USP50Q70EL3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 382.1 ms