Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
USP31Q70CQ4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP31Q70CQ4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
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