Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM47EQ6ZV65 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM47EQ6ZV65 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms