Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SPOCD1Q6ZMY3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms