Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMBR1LQ6UX01 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMBR1LQ6UX01 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMBR1LQ6UX01 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMBR1LQ6UX01 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMBR1LQ6UX01 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMBR1LQ6UX01 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMBR1LQ6UX01 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMBR1LQ6UX01 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBR1LQ6UX01 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBR1LQ6UX01 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBR1LQ6UX01 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBR1LQ6UX01 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBR1LQ6UX01 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBR1LQ6UX01 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBR1LQ6UX01 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBR1LQ6UX01 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBR1LQ6UX01 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBR1LQ6UX01 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMBR1LQ6UX01 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms