Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SFTA2Q6UW10 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms