Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA5Q6Q788 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms