Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q546

HUB1, Ubiquitin-like modifier HUB1, yeast

Predictions only

Length 73 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HUB1	Q6Q546	YDL007C-A	YDL007C-A	258 nt		-1.3	□□□□□ -2.62
HUB1	Q6Q546	YAP6	YDR259C	1152 nt		-1.3	□□□□□ -2.62
HUB1	Q6Q546	RSM18	YER050C	417 nt		-1.3	□□□□□ -2.62
HUB1	Q6Q546	SDS22	YKL193C	1017 nt		-1.3	□□□□□ -2.62
HUB1	Q6Q546	YLR146W-A	YLR146W-A	189 nt		-1.3	□□□□□ -2.62
HUB1	Q6Q546	YJL113W	YJL113W	4647 nt		-1.3	□□□□□ -2.62
HUB1	Q6Q546	RSM23	YGL129C	1353 nt		-1.31	□□□□□ -2.62
HUB1	Q6Q546	YIL071W-A	YIL071W-A	477 nt		-1.31	□□□□□ -2.62
HUB1	Q6Q546	COX7	YMR256C	183 nt		-1.31	□□□□□ -2.62
HUB1	Q6Q546	snR161	snR161	161 nt		-1.32	□□□□□ -2.62
HUB1	Q6Q546	SUS1	YBR111W-A	291 nt		-1.32	□□□□□ -2.62
HUB1	Q6Q546	YPL060C-A	YPL060C-A	3315 nt		-1.32	□□□□□ -2.62
HUB1	Q6Q546	YKL068W-A	YKL068W-A	237 nt		-1.33	□□□□□ -2.62
HUB1	Q6Q546	YLL006W-A	YLL006W-A	177 nt		-1.33	□□□□□ -2.62
HUB1	Q6Q546	CMS1	YLR003C	876 nt		-1.33	□□□□□ -2.62
HUB1	Q6Q546	ISF1	YMR081C	1017 nt		-1.33	□□□□□ -2.62
HUB1	Q6Q546	YMR290W-A	YMR290W-A	348 nt		-1.33	□□□□□ -2.62
HUB1	Q6Q546	YHL046W-A	YHL046W-A	327 nt		-1.34	□□□□□ -2.62
HUB1	Q6Q546	YLR287C	YLR287C	1068 nt		-1.34	□□□□□ -2.62
HUB1	Q6Q546	YER158W-A	YER158W-A	216 nt		-1.35	□□□□□ -2.63
HUB1	Q6Q546	YJL086C	YJL086C	369 nt		-1.35	□□□□□ -2.63
HUB1	Q6Q546	YBL008W-A	YBL008W-A	240 nt		-1.35	□□□□□ -2.63
HUB1	Q6Q546	SPO21	YOL091W	1830 nt		-1.36	□□□□□ -2.63
HUB1	Q6Q546	YDR290W	YDR290W	330 nt		-1.36	□□□□□ -2.63
HUB1	Q6Q546	GRX5	YPL059W	453 nt		-1.37	□□□□□ -2.63
HUB1	Q6Q546	RPS25B	YLR333C	327 nt		-1.38	□□□□□ -2.63
HUB1	Q6Q546	BLS1	YLR408C	369 nt		-1.39	□□□□□ -2.63
HUB1	Q6Q546	YML007C-A	YML007C-A	111 nt		-1.39	□□□□□ -2.63
HUB1	Q6Q546	LSM4	YER112W	564 nt		-1.41	□□□□□ -2.64
HUB1	Q6Q546	tT(UGU)Q1	tT(UGU)Q1	76 nt		-1.41	□□□□□ -2.64
HUB1	Q6Q546	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-1.41	□□□□□ -2.64
HUB1	Q6Q546	ATG31	YDR022C	591 nt		-1.42	□□□□□ -2.64
HUB1	Q6Q546	GPX1	YKL026C	504 nt		-1.42	□□□□□ -2.64
HUB1	Q6Q546	tA(UGC)Q	tA(UGC)Q	76 nt		-1.43	□□□□□ -2.64
HUB1	Q6Q546	YLR171W	YLR171W	390 nt		-1.43	□□□□□ -2.64
HUB1	Q6Q546	YMR158W-B	YMR158W-B	321 nt		-1.45	□□□□□ -2.64
HUB1	Q6Q546	THG1	YGR024C	714 nt		-1.46	□□□□□ -2.64
HUB1	Q6Q546	YML108W	YML108W	318 nt		-1.46	□□□□□ -2.64
HUB1	Q6Q546	YDL185C-A	YDL185C-A	228 nt		-1.47	□□□□□ -2.64
HUB1	Q6Q546	YDR269C	YDR269C	324 nt		-1.47	□□□□□ -2.64
HUB1	Q6Q546	YBR099C	YBR099C	384 nt		-1.47	□□□□□ -2.64
HUB1	Q6Q546	YHR054C	YHR054C	1065 nt		-1.48	□□□□□ -2.65
HUB1	Q6Q546	PBI2	YNL015W	228 nt		-1.48	□□□□□ -2.65
HUB1	Q6Q546	PCF11	YDR228C	1881 nt		-1.48	□□□□□ -2.65
HUB1	Q6Q546	YHR138C	YHR138C	345 nt		-1.49	□□□□□ -2.65
HUB1	Q6Q546	YOL160W	YOL160W	342 nt		-1.49	□□□□□ -2.65
HUB1	Q6Q546	EST1	YLR233C	2100 nt		-1.49	□□□□□ -2.65
HUB1	Q6Q546	YCR038W-A	YCR038W-A	126 nt		-1.5	□□□□□ -2.65
HUB1	Q6Q546	DFG10	YIL049W	762 nt		-1.51	□□□□□ -2.65
HUB1	Q6Q546	YJR140W-A	YJR140W-A	150 nt		-1.51	□□□□□ -2.65
HUB1	Q6Q546	VPS63	YLR261C	327 nt		-1.52	□□□□□ -2.65
HUB1	Q6Q546	RPS10B	YMR230W	318 nt		-1.52	□□□□□ -2.65
HUB1	Q6Q546	YER079W	YER079W	633 nt		-1.53	□□□□□ -2.65
HUB1	Q6Q546	DCP1	YOL149W	696 nt		-1.53	□□□□□ -2.65
HUB1	Q6Q546	YOR020W-A	YOR020W-A	273 nt		-1.53	□□□□□ -2.65
HUB1	Q6Q546	YIR044C	YIR044C	186 nt		-1.54	□□□□□ -2.66
HUB1	Q6Q546	EMC4	YGL231C	573 nt		-1.56	□□□□□ -2.66
HUB1	Q6Q546	RUF20	RUF20	443 nt		-1.56	□□□□□ -2.66
HUB1	Q6Q546	YPL261C	YPL261C	309 nt		-1.56	□□□□□ -2.66
HUB1	Q6Q546	SVS1	YPL163C	783 nt		-1.57	□□□□□ -2.66
HUB1	Q6Q546	SDH7	YDR511W	402 nt		-1.58	□□□□□ -2.66
HUB1	Q6Q546	YLR041W	YLR041W	321 nt		-1.59	□□□□□ -2.66
HUB1	Q6Q546	IRC16	YPR038W	360 nt		-1.59	□□□□□ -2.66
HUB1	Q6Q546	YMR307C-A	YMR307C-A	195 nt		-1.6	□□□□□ -2.67
HUB1	Q6Q546	YOL029C	YOL029C	606 nt		-1.6	□□□□□ -2.67
HUB1	Q6Q546	snR59	snR59	78 nt		-1.61	□□□□□ -2.67
HUB1	Q6Q546	snR72	snR72	98 nt		-1.61	□□□□□ -2.67
HUB1	Q6Q546	CWC23	YGL128C	852 nt		-1.62	□□□□□ -2.67
HUB1	Q6Q546	LRP1	YHR081W	555 nt		-1.62	□□□□□ -2.67
HUB1	Q6Q546	YJL026C-A	YJL026C-A	222 nt		-1.62	□□□□□ -2.67
HUB1	Q6Q546	YKL111C	YKL111C	336 nt		-1.62	□□□□□ -2.67
HUB1	Q6Q546	YNL171C	YNL171C	369 nt		-1.62	□□□□□ -2.67
HUB1	Q6Q546	YPR092W	YPR092W	306 nt		-1.62	□□□□□ -2.67
HUB1	Q6Q546	YGR228W	YGR228W	345 nt		-1.63	□□□□□ -2.67
HUB1	Q6Q546	PAU9	YBL108C-A	129 nt		-1.63	□□□□□ -2.67
HUB1	Q6Q546	LIN1	YHR156C	1023 nt		-1.64	□□□□□ -2.67
HUB1	Q6Q546	YCR018C-A	YCR018C-A	255 nt		-1.65	□□□□□ -2.67
HUB1	Q6Q546	POL32	YJR043C	1053 nt		-1.65	□□□□□ -2.67
HUB1	Q6Q546	YOL106W	YOL106W	354 nt		-1.65	□□□□□ -2.67
HUB1	Q6Q546	SNU13	YEL026W	381 nt		-1.67	□□□□□ -2.68
HUB1	Q6Q546	BLI1	YKL061W	342 nt		-1.67	□□□□□ -2.68
HUB1	Q6Q546	tP(UGG)Q	tP(UGG)Q	72 nt		-1.68	□□□□□ -2.68
HUB1	Q6Q546	CMC1	YKL137W	336 nt		-1.68	□□□□□ -2.68
HUB1	Q6Q546	YOR364W	YOR364W	369 nt		-1.68	□□□□□ -2.68
HUB1	Q6Q546	LOC1	YFR001W	615 nt		-1.69	□□□□□ -2.68
HUB1	Q6Q546	YGL258W-A	YGL258W-A	234 nt		-1.7	□□□□□ -2.68
HUB1	Q6Q546	RPF1	YHR088W	888 nt		-1.7	□□□□□ -2.68
HUB1	Q6Q546	SPC24	YMR117C	642 nt		-1.7	□□□□□ -2.68
HUB1	Q6Q546	AI5_BETA	Q0075	1065 nt		-1.71	□□□□□ -2.68
HUB1	Q6Q546	POP6	YGR030C	477 nt		-1.71	□□□□□ -2.68
HUB1	Q6Q546	YIL066W-A	YIL066W-A	444 nt		-1.71	□□□□□ -2.68
HUB1	Q6Q546	TAR1	YLR154W-C	375 nt		-1.71	□□□□□ -2.68
HUB1	Q6Q546	BER1	YLR412W	825 nt		-1.72	□□□□□ -2.68
HUB1	Q6Q546	YER188C-A	YER188C-A	300 nt		-1.73	□□□□□ -2.69
HUB1	Q6Q546	RPS20	YHL015W	366 nt		-1.73	□□□□□ -2.69
HUB1	Q6Q546	YJL182C	YJL182C	318 nt		-1.73	□□□□□ -2.69
HUB1	Q6Q546	YML100W-A	YML100W-A	174 nt		-1.73	□□□□□ -2.69
HUB1	Q6Q546	YMR304C-A	YMR304C-A	351 nt		-1.73	□□□□□ -2.69
HUB1	Q6Q546	YMR254C	YMR254C	309 nt		-1.74	□□□□□ -2.69
HUB1	Q6Q546	ACF4	YJR083C	930 nt		-1.76	□□□□□ -2.69

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