Protein–RNA interactions for Protein: Q6P474

PDXDC2P, Putative pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXDC2PQ6P474 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDXDC2PQ6P474 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXDC2PQ6P474 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXDC2PQ6P474 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXDC2PQ6P474 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXDC2PQ6P474 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXDC2PQ6P474 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXDC2PQ6P474 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXDC2PQ6P474 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDXDC2PQ6P474 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms