Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOBEC3HQ6NTF7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOBEC3HQ6NTF7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms