Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRT80Q6KB66 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169 ms