Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SDE2Q6IQ49 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms