Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CARMIL2Q6F5E8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CARMIL2Q6F5E8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
CARMIL2Q6F5E8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
CARMIL2Q6F5E8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CARMIL2Q6F5E8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms