Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 AC009652.1-201ENST00000528326 648 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CHIC1Q5VXU3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 LINC01513-201ENST00000416930 483 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHIC1Q5VXU3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms