Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SUSD4Q5VX71 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms