Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC30Q5VVM6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms