Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms