Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH8Q5T0T0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH8Q5T0T0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms