Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC158Q5M9N0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC158Q5M9N0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms