Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RPL39P5Q59GN2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL39P5Q59GN2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms