Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COBLL1Q53SF7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms