Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TPRNQ4KMQ1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TPRNQ4KMQ1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
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