Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM71Q2Q1W2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM71Q2Q1W2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM71Q2Q1W2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM71Q2Q1W2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM71Q2Q1W2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM71Q2Q1W2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM71Q2Q1W2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM71Q2Q1W2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM71Q2Q1W2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM71Q2Q1W2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM71Q2Q1W2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM71Q2Q1W2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms