Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC27Q2M243 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC27Q2M243 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms