Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFX7Q2KHR2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFX7Q2KHR2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms