Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC142Q17RM4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC142Q17RM4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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