Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRNQ16849 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRNQ16849 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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