Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CLPPQ16740 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CLPPQ16740 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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