Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SGCBQ16585 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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