Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CARTPTQ16568 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CARTPTQ16568 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms