Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLFQ16534 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLFQ16534 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLFQ16534 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLFQ16534 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLFQ16534 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLFQ16534 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HLFQ16534 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLFQ16534 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLFQ16534 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLFQ16534 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLFQ16534 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLFQ16534 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLFQ16534 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLFQ16534 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLFQ16534 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLFQ16534 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLFQ16534 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLFQ16534 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLFQ16534 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLFQ16534 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLFQ16534 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLFQ16534 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLFQ16534 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLFQ16534 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLFQ16534 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLFQ16534 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLFQ16534 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLFQ16534 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLFQ16534 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLFQ16534 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLFQ16534 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLFQ16534 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLFQ16534 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLFQ16534 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLFQ16534 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLFQ16534 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLFQ16534 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLFQ16534 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLFQ16534 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLFQ16534 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLFQ16534 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLFQ16534 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLFQ16534 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLFQ16534 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLFQ16534 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HLFQ16534 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLFQ16534 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLFQ16534 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLFQ16534 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLFQ16534 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLFQ16534 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLFQ16534 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLFQ16534 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLFQ16534 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLFQ16534 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLFQ16534 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLFQ16534 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HLFQ16534 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLFQ16534 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLFQ16534 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLFQ16534 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLFQ16534 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLFQ16534 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLFQ16534 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HLFQ16534 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLFQ16534 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLFQ16534 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLFQ16534 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLFQ16534 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLFQ16534 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLFQ16534 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HLFQ16534 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLFQ16534 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HLFQ16534 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HLFQ16534 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLFQ16534 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLFQ16534 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLFQ16534 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HLFQ16534 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HLFQ16534 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLFQ16534 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLFQ16534 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLFQ16534 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLFQ16534 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLFQ16534 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLFQ16534 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLFQ16534 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLFQ16534 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLFQ16534 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLFQ16534 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLFQ16534 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLFQ16534 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLFQ16534 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLFQ16534 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLFQ16534 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HLFQ16534 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLFQ16534 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLFQ16534 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLFQ16534 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms