Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDB1Q16531 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDB1Q16531 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
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