Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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RPE65Q16518 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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RPE65Q16518 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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RPE65Q16518 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RPE65Q16518 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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