Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASIC2Q16515 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ASIC2Q16515 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ASIC2Q16515 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ASIC2Q16515 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ASIC2Q16515 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASIC2Q16515 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASIC2Q16515 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASIC2Q16515 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASIC2Q16515 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASIC2Q16515 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASIC2Q16515 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASIC2Q16515 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASIC2Q16515 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASIC2Q16515 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASIC2Q16515 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASIC2Q16515 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASIC2Q16515 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASIC2Q16515 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASIC2Q16515 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASIC2Q16515 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASIC2Q16515 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms