Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSX1Q16384 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSX1Q16384 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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