Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA4Q16363 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA4Q16363 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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