Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNGA3Q16281 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA3Q16281 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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