Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC6Q16204 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC6Q16204 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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