Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATP6AP1Q15904 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATP6AP1Q15904 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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