Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
VAMP3Q15836 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
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VAMP3Q15836 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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VAMP3Q15836 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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VAMP3Q15836 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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VAMP3Q15836 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VAMP3Q15836 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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